बायोइनफॉरमैटिक्स में पीएचडी

University of Tehran, Kish International Campus

कार्यक्रम विवरण

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बायोइनफॉरमैटिक्स में पीएचडी

University of Tehran, Kish International Campus

परिचय

बायोइनफॉरमैटिक्स जैविक, सूचनात्मक और कम्प्यूटेशनल विज्ञान के इंटरफेस में एक अंतःविषय विज्ञान है, जो जीव विज्ञान को समझने के लिए गणना का उपयोग करता है। जैव सूचना विज्ञान में जैविक डेटा का विश्लेषण, विशेष रूप से डीएनए, आरएनए, और प्रोटीन श्रृंखला शामिल है। बायोइनफॉरमैटिक्स के क्षेत्र में 1990 के दशक के मध्य में शुरू हुए विस्फोटक वृद्धि का अनुभव हुआ, जो मुख्यतः मानव जीनोम प्रोजेक्ट द्वारा संचालित था और डीएनए अनुक्रमण तकनीक में तेजी से प्रगति की। हाल ही में और उपन्यास प्रौद्योगिकियों में जैविक डेटा सेट बढ़ते हुए संकल्प के जैविक डेटा सेट का उत्पादन होता है, जो न केवल जीनोमिक अनुक्रमों को प्रकट करता है बल्कि आरएनए और प्रोटीन बहुतायत, एक दूसरे के साथ उनकी बातचीत, उनके subcellular स्थानीयकरण, और अन्य जैविक अणुओं की पहचान और बहुतायत। इसके लिए अत्याधुनिक कम्प्यूटेशनल विधियों के विकास और अनुप्रयोग की आवश्यकता होती है। बायोइनफॉरमैटिक जैविक डेटा में पैटर्न का विश्लेषण करने और जैविक गतिविधि के जटिल मॉडल को बनाने के लिए कम्प्यूटेशनल दृष्टिकोण का इस्तेमाल करता है, जिसमें जीन के कार्यों को स्पष्ट करने और आनुवांशिक Pathways में उनकी बातचीत को स्पष्ट करने के प्रयास शामिल हैं। जीवन के आनुवांशिक तंत्र और संबंधित प्रक्रियाओं से संबंधित नए ज्ञान के धन के शोषण से व्यापक सामाजिक लाभ की उम्मीद है।

जैव सूचना विज्ञान में विश्लेषण मुख्यतः आणविक जीव विज्ञान में उपलब्ध तीन प्रकार के बड़े डेटासेटों पर केंद्रित है: मैक्रोमोलेक्युलर संरचनाएं, जीनोम अनुक्रम, और कार्यात्मक जीनोमिक्स प्रयोगों के परिणाम (जैसे अभिव्यक्ति डेटा)। अतिरिक्त जानकारी में वैज्ञानिक पत्रों का पाठ और चयापचय Pathways , वर्गीकरण वृक्षों और प्रोटीन-प्रोटीन इंटरैक्शन नेटवर्क से "संबंध डेटा" शामिल है। बायोइनफॉर्मेटिक्स क्रमिक और संरचनात्मक संरेखण, डेटाबेस डिजाइन और डेटा खनन, मैक्रोमोलेक्युलर ज्यामिति, फ़िलेगोनेटिक पेड़ निर्माण, प्रोटीन संरचना और फ़ंक्शन की भविष्यवाणी, जीन खोज और अभिव्यक्ति डेटा क्लस्टरिंग सहित कम्प्यूटेशनल तकनीकों की एक विस्तृत श्रृंखला को रोजगार देते हैं। जोर विभिन्न कम्प्यूटेशनल विधियों और विषम डेटा स्रोतों को एकीकृत करने के दृष्टिकोण पर है।

कीश अंतरराष्ट्रीय परिसर में बायोइनफॉर्मेटिक्स में पीएचडी कार्यक्रम का मुख्य उद्देश्य शिक्षा, उद्योग और सरकार में करियर के लिए कम्प्यूटेशनल जीवविज्ञानी की अगली पीढ़ी को प्रशिक्षित करना है।

पीएचडी पाठ्यक्रम

बायोइनफॉरमैटिक्स के पीएचडी को 32 क्रेडिट्स, कोर कोर्स (9 क्रेडिट), एक सेमिनार (1 क्रेडिट) और वैकल्पिक पाठ्यक्रमों के 8 क्रेडिट और पीएचडी थीसिस (18 क्रेडिट्स) का पूरा होना आवश्यक है। इस कार्यक्रम का मुख्य जोर एक मूल और स्वतंत्र शोध परियोजना के सफल समापन पर है जो एक शोध प्रबंध के रूप में लिखा गया और बचाव किया।

व्यापक परीक्षा

चौथा सेमेस्टर के अंत में व्यापक परीक्षा पूरी की जानी चाहिए और एक छात्र पीएचडी प्रस्ताव का बचाव करने से पहले आवश्यक हो सकता है। पीएचडी व्यापक परीक्षा पास करने के लिए छात्रों के दो मौके होंगे यदि छात्रों को अपनी पहली व्यापक परीक्षा प्रयास पर "असंतोषजनक" का मूल्यांकन प्राप्त होता है, तो छात्र एक बार क्वालीफायर को फिर से ले सकता है दूसरी विफलता के परिणामस्वरूप कार्यक्रम समाप्त हो जाएगा। व्यापक परीक्षा यह सुनिश्चित करने के लिए डिज़ाइन की गई है कि छात्र अनुसंधान अनुभव प्राप्त करने में प्रारंभ होता है; यह यह भी सुनिश्चित करता है कि छात्र को डॉक्टरेट-स्तरीय अनुसंधान करने की क्षमता है

पीएचडी प्रस्तावित

पीएचडी प्रस्ताव में विशिष्ट उद्देश्य, अनुसंधान डिजाइन और तरीके, और प्रस्तावित कार्य और समयरेखा शामिल होना चाहिए। इसके अलावा, प्रस्ताव में एक ग्रंथसूची भी होनी चाहिए, और संलग्नक के रूप में, कोई प्रकाशन / पूरक सामग्री छात्र को मौखिक परीक्षा में अपने समिति को अपने शोध प्रस्ताव का बचाव करना चाहिए।

थीसिस

संकाय समिति द्वारा अनुमोदित पीएचडी कार्यक्रम में होने के पहले वर्ष के भीतर एक छात्र को एक थीसिस सलाहकार (और एक या दो सह-सलाहकारों की आवश्यकता) का चयन करना चाहिए। दूसरे वर्ष, पीएचडी प्रस्ताव के साथ-साथ सलाहकार द्वारा सुझाई गई थीसिस कमेटी को अनुमोदन के लिए सौंप दिया जाना चाहिए। थीसिस कमेटी में कम से कम पांच संकाय सदस्यों का होना चाहिए। थीसिस समिति के दो सदस्यों को अन्य विश्वविद्यालयों से एसोसिएट प्रोफेसर स्तर पर होना चाहिए। बाद में पांचवी सेमेस्टर के अंत की तुलना में, एक छात्र को एक लिखित पीएचडी प्रस्ताव पेश करना और बचाव करना है।

अनुसंधान प्रगति

एक छात्र को उम्मीद है कि शोध प्रोद्योगिकी की समीक्षा करने के लिए वर्ष में कम से कम एक बार अपनी थीसिस कमेटी से मिलना होगा। प्रत्येक विश्वविद्यालय कैलेंडर वर्ष की शुरुआत में, प्रत्येक छात्र और छात्र के सलाहकार को छात्र की प्रगति के मूल्यांकन मूल्यांकन, चालू वर्ष के लिए पिछले साल की उपलब्धियों और योजनाओं को प्रस्तुत करना आवश्यक है। थीसिस कमेटी इन सारांशों की समीक्षा करता है और छात्र को कार्यक्रम में उनकी स्थिति का सारांश देने वाला एक पत्र भेजता है। संतोषजनक प्रगति करने में असफल रहने वाले छात्र किसी भी कमी को दूर करने और एक वर्ष के भीतर अगले मील का पत्थर तक पहुंचने की संभावना रखते हैं। ऐसा करने में विफलता कार्यक्रम से बर्खास्तगी का परिणाम देगा।

पीएचडी विस्थापन

पीएचडी कार्यक्रम में प्रवेश करने के 4 सालों के भीतर, छात्र को शोध प्रबंध पूरा करने की उम्मीद है; छात्र के पास सह-समीक्षा पत्रिकाओं में स्वीकार किए गए या प्रकाशित किए गए शोध के परिणाम होने चाहिए। एक लिखित थीसिस और सार्वजनिक रक्षा और समिति द्वारा अनुमोदन प्रस्तुत करने पर, छात्र पीएचडी की डिग्री से सम्मानित किया गया है। रक्षा में (1) स्नातक छात्र द्वारा शोध प्रबंध की प्रस्तुति, (2) सामान्य दर्शकों द्वारा पूछताछ की जाएगी, और (3) शोध प्रबंध समिति द्वारा बंद दरवाजा पूछताछ शोध प्रबंध रक्षा के सभी तीन भागों के पूरा होने पर छात्र को परीक्षा परिणाम के बारे में बताया जाएगा। समिति के सभी सदस्यों को डॉक्टरेट समिति की अंतिम रिपोर्ट और निबंध के अंतिम संस्करण पर हस्ताक्षर करना होगा।

स्नातक स्तर की पढ़ाई के लिए 16 से 20 का न्यूनतम जीपीए रखा जाना चाहिए।

स्तर पाठ्यक्रम (डिग्री के लिए लागू नहीं)

बायोइनफॉरमैटिक्स में पीएचडी संबंधित क्षेत्रों में एक मास्टर डिग्री मानता है। हालांकि, छात्रों को किसी अन्य मास्टर डिग्री के अलावा, निम्नलिखित स्तरीय पाठ्यक्रमों में से कुछ को पूरा करना होगा, जो पीएचडी पाठ्यक्रमों की पृष्ठभूमि प्रदान करने के लिए डिज़ाइन किए गए हैं। इन समतलन पाठ्यक्रमों को स्नातक क्रेडिट के लिए बायोइनफॉरमैटिक्स में पीएचडी की ओर नहीं गिना जाता है।

स्तर के पाठ्यक्रम: अधिकतम 3 पाठ्यक्रमों की आवश्यकता; 6 क्रेडिट

कोर पाठ्यक्रम: 4 पाठ्यक्रम आवश्यक; 10 क्रेडिट

वैकल्पिक पाठ्यक्रम: 4 पाठ्यक्रम आवश्यक, 8 क्रेडिट

पाठ्यक्रम विवरण

उन्नत जैव सूचना विज्ञान

अध्य्यन विषयवस्तु:
जैव सूचना विज्ञान, परिचय आणविक जीवविज्ञान, जैविक डेटाबेस, मैटैब के साथ जैविक अनुक्रमों को प्रसंस्करण, अनुक्रम मनोविज्ञान, प्रोटीन संरेखण, बहु अनुक्रम संरेखण, संरेखण उपकरण, बैलोलिङिक पद्धति के तरीके, अनुक्रम मॉडल, अनुवर्ती पैटर्न मॉडल, जीन मॉडल, फिलाोजेनिक पुनर्निर्माण, दूरी का परिचय आधारित तरीके, कैरेक्टर-बेस्ड तरीके: पार्सिमनी, प्रोबबिलीस्टिक मेथड्स: अधिकतम संभावना, माइक्रोआरए, मैटलब

जैव सूचना विज्ञान में एल्गोरिदम

अध्य्यन विषयवस्तु:
आणविक जीवविज्ञान का परिचय, अनुक्रम समानता, प्रत्यय वृक्ष, जीनोम संरेखण, डेटाबेस खोज, एकाधिक अनुक्रम संरेखण, फाइलोजी पुनर्निर्माण, फाइलोजी तुलना, जीनोम पुनरोद्धार, आकृति खोज, आरएनए द्वितीयक संरचना अनुमान, पेप्टाइड अनुक्रमण, जनसंख्या आनुवांशिकी

संरचनात्मक जैव सूचना विज्ञान

अध्य्यन विषयवस्तु:
आणविक मॉडलिंग को नियंत्रित करना, बायोइनफॉरमैटिक्स और स्ट्रक्चरल परिभाषित करना, प्रोटीन संरचना की बुनियादी बातों, स्ट्रक्चरल में खोज और नमूनाकरण, खोज तरीकों, डेटा विश्लेषण और कमी, आणविक दृश्य

कम्प्यूटेशनल जीनोमिक्स

अध्य्यन विषयवस्तु:
परिचय, जेनेटिक महामारी विज्ञान की अवधारणाओं, लिंकेज विश्लेषण का एकीकरण और अगली पीढ़ी के सिक्वेंसिंग डाटा, मानव परिसर रोगों के अध्ययन के लिए आणविक लक्षणों के क्यू एल एल मैपिंग, आनुवंशिक मार्कर से जीन भविष्यवाणी, एक्सएम अनुक्रम डेटा के लिए विश्लेषणात्मक दृष्टिकोण, दुर्लभ विविधता विश्लेषण असंबंधित व्यक्तियों में, जीन दोहराव और कार्यात्मक परिणाम, जीडब्ल्यूएएस से मानव परिसर के रोगों पर अगली पीढ़ी की सिक्वेंसिंग से अनुवादकीय चिकित्सा और चिकित्सा विज्ञान के लिए निहितार्थ

मेटाबोलिक मॉडलिंग

अध्य्यन विषयवस्तु:
मेटाबोलिक मॉडलिंग से इंजीनियरिंग सिंथेटिक मेटाबोलंस बायोसिनेटल डिवाइसों के रेशनल डिजाइन के लिए, सिंथेटिक स्ट्ररोल का निर्माण, कम्प्यूटेशनल विकास के रहस्यों को अनलॉक करता है? , आणविक गतिशीलता सिमुलेशन, बायोमोलेक्लस के इम्प्लास्टिक इलेक्ट्रोस्टैटिक्स के लिए फास्ट सॉल्वर, बायोकेमिकल माइक्रोराएक्टरों के मॉडल-आधारित डिजाइन के आधार पर सुक्रोज के विशिष्ट पोरिन स्क्रीटी के लक्षण, कार्बोहाइड्रेट-सक्रिय एंजाइमों और बायोसिंथेटिक ग्लाइमटेरियल्स पर इन विट्रो अध्ययनों के साथ स्टार्च बायोलॉजी को कम करना, कॉम्प्लेटालिजेशन और पौधों में सिंथेटिक जीव विज्ञान के लिए सिंथेटिक vesicles, मेटाबोलामीक्स मानकों और मेटाबोलिक मॉडलिंग में ट्रांसपोर्ट, प्रायोगिक साक्ष्य के साथ संगत प्रसंग हैं? , मैकोबॉलिक उत्पादकता में सुधार के लिए पेप्टाइड म्यूटिफ्स और कॉग्नेट एडाप्टर डोमेन के आधार पर प्रोटीन मिमिक्स, सिंथेटिक प्रोटीन स्कैफॉल्ड्स, कृत्रिम एंजाइम चैनलों द्वारा चयापचय Pathways इंजीनियरिंग के लिए निकोटीया बेंटमियाना में सिंथेटिक पेप्टाइड्स में ग्लेकोरफेनिन प्रीकोरर डायहोमेमेथियोनिन के इंजीनियर उत्पादन का अनुकूलन,

सिस्टम जीव विज्ञान में मॉडलिंग

अध्य्यन विषयवस्तु:
जैविक मूल बातें, गणितीय मॉडलिंग की बुनियादी बातों, मॉडल अंशांकन और प्रायोगिक डिजाइन, सेलुलर प्रक्रियाओं के मॉडलिंग, एंजाइमिक रूपांतरण, पोलीमराइज़ेशन प्रक्रिया, सिग्नल ट्रांस्डक्शन और आनुवंशिक रूप से विनियमित सिस्टम, मॉड्यूल और आकृति का विश्लेषण, मॉडल विश्लेषण के सामान्य तरीके, नियंत्रण सिद्धांत के पहलुओं, आकृति सेल्युलर नेटवर्क में, सेल्यूलर नेटवर्क का विश्लेषण, मेटाबोलिक इंजीनियरिंग, टोपोलॉजीकल अभिलक्षण

उन्नत डेटा खनन

अध्य्यन विषयवस्तु:
बायोइनफॉरमैटिक्स में डाटा माइनिंग का परिचय, बायोइन्फॉर्मेटिक्स में पदानुक्रमित प्रोफाइलिंग और एप्लीकेशन मल्टीपल स्कोरिंग सिस्टम, डीएनए सीक्वेंस विज़ुअलाइज़ेशन, मास स्पेक्ट्रोमेट्री के साथ प्रोमोमीक्स, बड़े फाइलोजेनेटिक डाटासेट्स के कुशल और मजबूत विश्लेषण, प्रोटीन थ्रेडिंग, पैटर्न विभेदों के एल्गोरिदमिक पहलुओं और विषुव जीनोमिक डेटा के लिए योग, जीन अभिव्यक्ति विश्लेषण के लिए पैरामाइथलेस क्लस्टरिंग तकनीक, कैंसर के आणविक वर्गीकरण के लिए संयुक्त भेदभावपूर्ण जीन चयन, सामान्य रोगों की जीन की खोज के लिए एक हप्लोटिप विश्लेषण प्रणाली, प्रोटीन के लक्षणों की क्लस्टरिंग सटीकता में सुधार के लिए एक बायिसियन फ्रेमवर्क

मशीन लर्निंग

अध्य्यन विषयवस्तु:
हमें मशीन सीखने, मशीन सीखने के आंकड़ों और डेटा विश्लेषिकी, पैटर्न पहचान, तंत्रिका नेटवर्क और गहरी सीखने, लर्निंग क्लस्टर और सिफारिशों में रुचि क्यों है, कार्रवाई करने के लिए सीखना, हम यहां से कहां जाते हैं?

कंप्यूटर सहायता प्राप्त औषध डिजाइन

अध्य्यन विषयवस्तु:
क्वांटम मैकेनिकल और आण्विक मैकेनिकल दृष्टिकोण, ट्रांजिशन मेटल सिस्टम्स, कठोर निकाय द्वारा प्रोटीन-प्रोटीन इंटरैक्शन, क्यूएम आधारित मॉडलिंग, वर्तमान स्थिति और भविष्य
This school offers programs in:
  • अंग्रेज़ी


अंतिम March 27, 2018 अद्यतन.
अवधि और कीमत
This course is कैम्पस आधारित
Start Date
शूरुवाती तारीक
Sept. 2019
Duration
अवधि
आंशिक समय
पुरा समय
Locations
ईरान - Tehran, Tehran Province
शूरुवाती तारीक : Sept. 2019
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Dates
Sept. 2019
ईरान - Tehran, Tehran Province
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